Les systèmes de vigilances sanitaires correspondent au recueil, à l'enregistrement et à l’évaluation d’incidents ou d’effets indésirables susceptibles d’être liés à l’utilisation des produits de santé. Ils sont définis dans le Code de la santé publique.

L’Agence Nationale de Sécurité du Médicament et des Produits de Santé (ANSM) a en charge huit vigilances différentes :

• la pharmacovigilance pour les médicaments à usage humain et les matières premières à usage pharmaceutique
• la pharmacodépendance ou addictovigilance pour les substances psychoactives dont les stupéfiants et les psychotropes
• l'hémovigilance pour l’ensemble de la chaîne transfusionnelle du prélèvement du donneur au suivi post-transfusionnel du receveur de produits sanguins labiles
• la matériovigilance pour les dispositifs médicaux et les produits thérapeutiques annexes
• la réactovigilance pour les dispositifs de diagnostic in vitro
• la biovigilance pour l’ensemble de la chaîne de greffe du prélèvement du donneur au suivi post-greffe du receveur d’organes, de tissus, de cellules d’origine humaine excepté le sang et les gamètes, et pour les produits thérapeutiques annexes
• la cosmétovigilance pour les produits cosmétiques
• la vigilance des produits de tatouages pour les produits de tatouages

L'Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l'alimentation, de l'Environnement et du travail (ANSES) est chargée de deux vigilances:

• la toxicovigilance pour la surveillance des effets toxiques de l’exposition à un mélange ou une substance disponible sur le marché ou présent(e) dans l’environnement
• la nutrivigilance pour certaines denrées alimentaires 

L'Agence de Sûreté Nucléaire (ASN) est en charge de :

• la radiovigilance qui concerne les rayonnements ionisants dans le cadre des activités de radiologie

Depuis le 13 mars 2017, les professionnels de santé ou les usagers peuvent signaler en quelques clics aux autorités sanitaires tout événement indésirable sur le site signalement-sante.gouv.fr, dont les effets indésirables, incidents ou risques d'incidents liés aux activités et produits de santé.